Με θετικό μάτι βλέπουν οι πρυτάνεις την απόφαση της κυβέρνησης να επιτρέψει τη χρηματοδότηση πανεπιστημίων από ιδιώτες, αποδεσμεύοντας τους Λογαριασμούς Ερευνας των ΑΕΙ από τις αυστηρές διαδικασίες της Ενιαίας Αρχής Πληρωμών.Ωστόσο, τα πανεπιστήμια καταγγέλλουν την περικοπή της χρηματοδότησης , επισημαίνοντας ότι η λειτουργία των πανεπιστημίων θα υποβαθμισθεί και γι' αυτό ζητά από την κυβέρνηση πολιτική λύση με στόχο την ενίσχυση της τριτοβάθμιας εκπαίδευσης.
Συγκεκριμένα, το προεδρείο της Συνόδου των Πρυτάνεων, σε ανακοίνωσή του, εξέφρασε «την ικανοποίηση του για την αποδέσμευση των ΕΛΚΕ των πανεπιστημίων από την Ενιαία Αρχή Πληρωμών, η οποία αποφασίστηκε από την κυβέρνηση κατόπιν σχετικής πρότασης του υπουργού Παιδείας. Η αποδέσμευση από την ΕΑΠ αποτελούσε πάγιο αίτημα της Συνόδου Πρυτάνεων, δεδομένου ότι υφίσταται σοβαρό αντικίνητρο για την ανάπτυξη της έρευνας και την διαχείριση χρηματοδοτούμενων προγραμμάτων, στα οποία απασχολούνται πολλοί φοιτητές και ερευνητές».
Από την άλλη πάντως, το προεδρείο της Συνόδου (αποτελείται από τους πρυτάνεις του Πανεπιστημίου Αιγαίου Πάρι Τσάρτα, του Χαροκόπειου Πανεπιστημίου Δημοσθένη Αναγνωστόπουλο, και του ΑΠΘ Γιάννη Μυλόπουλο) εκφράζει «εκ νέου την έντονη διαφωνία του για τη μείωση των προϋπολογισμών των πανεπιστημίων, η οποία οδηγεί σε πλήρη αδυναμία λειτουργίας τους, καθότι έχει υπερβεί αθροιστικά το 50-60% την τελευταία τετραετία» Και τονίζει: «Η νέα μείωση των προϋπολογισμών δεν αντισταθμίζεται με οποιοδήποτε τρόπο από τις εξελίξεις που αφορούν στα ζητήματα των ΕΛΚΕ. Για το λόγο αυτό, τονίζεται εκ νέου ότι η νέα μείωση θα καταστήσει ανέφικτη την εκπλήρωση της αποστολής των Ιδρυμάτων προς την κοινωνία και ζητείται να υπάρξει πολιτική λύση ενίσχυσης της τριτοβάθμιας εκπαίδευσης».
Την ίδια στιγμή το υπουργείο Παιδείας παράλαβε από την αξιολογήτρια εταιρία ΤEC S.A. ( Strategy consultants) την αξιολόγηση των διοικητικών δομών των οκτώ Πανεπιστημίων που έχουν προσφέρει 1.164 διαθέσιμους διοικητικούς υπαλλήλους. Το κείμενο της αξιολόγησης εστάλη στον Πρόεδρο της Διαρκούς Επιτροπής Μορφωτικών Υποθέσεων, κ. Σπύρο Ταλιαδούρο.
Με βάση το πόρισμα της αξιολόγησης για καθένα από τα οκτώ ΑΕΙ, η κυβέρνηση θα κρίνει εάν απαιτείται η προκήρυξη επιπλέον θέσεων διοικητικών, πέραν των 600 που προκηρύχθηκαν για 9 πανεπιστήμια (μεταξύ αυτών και τα 8 που «προσέφεραν» διαθέσιμους) και 6 ΤΕΙ είτε επειδή υπήρχε έλλειμμα διοικητικού προσωπικού, είτε επειδή κάποιοι διοικητικοί με διδακτορικό κατέλαβαν θέσεις ειδικού επιστημονικού και τεχνικού προσωπικού.